北交所与沪深交易所的区别不仅大，而且是根植于市场定位、制度设计和市场生态的系统性差异。作为中国多层次资本市场的关键组成部分，这三者形成了清晰的错位发展与功能互补格局，其区别远非细微末节，而是构成了服务于不同发展阶段企业的鲜明板块。北交所是专为创新型中小企业，尤其是专精特新企业打造的专属融资平台和孵化器，而沪深交易所则长期服务于更为成熟、具备稳定业绩的大型企业及行业龙头。这种差异是根本性的，源于国家构建多层次资本市场的顶层设计，让不同规模、不同成长阶段的企业都能找到适合自己的资本舞台，因此理解这一区别是把握当前中国资本市场格局的基础。
核心区别首先体现在市场定位与上市门槛上。北交所自诞生之初就明确服务于更早、更小、更新的创新型中小企业，其上市条件体现了更大的包容性和灵活性，最低市值要求显著低于沪深交易所，对企业的盈利要求也更为宽松。与之形成对比的是，沪深交易所则聚焦于更为成熟的企业群体：上交所主板侧重大型蓝筹企业，科创板专注硬科技创新；深交所主板服务成熟企业，创业板则定位于成长型创新创业企业。这种梯度化的上市门槛，使得北交所成为有潜力但尚未达到沪深上市标准的中小企业登陆公开资本市场的快速通道，两者的服务对象和所处发展阶段截然不同。
交易机制与市场弹性的不同，是投资者能最直观感受到的差异。北交所实行更为宽松的价格波动区间，个股日常涨跌幅限制高达30%，新股上市首日则不设涨跌幅限制，这些规则都远宽于沪深主板10%和科创板、创业板20%的限制。北交所在交易申报上允许以1股为单位递增，提供了比沪深市场（通常要求100股整数倍）更细微的交易灵活性。这些制度设计增加市场弹性，促进价格发现，但也意味着北交所个股可能面临更大的价格波动风险。这种宽幅波动的特性，与沪深市场相对平稳的节奏形成了鲜明对比，直接影响投资者的交易策略和风险承受体验。
投资者结构与参与门槛的设定，进一步塑造了二者截然不同的市场生态。北交所设置了较高的个人投资者准入门槛，要求证券账户日均资产不低于50万元且具备2年以上证券投资经验。这一双高要求将大多数散户投资者挡在门外，使得北交所以机构投资者和专业投资者为主导力量，市场风格相对更为理性。反观沪深交易所，尤其是主板市场，开户门槛很低，拥有数量极为庞大的散户投资者群体，市场流动性更强，但情绪化交易特征也更为明显。这种投资者结构的巨大反差，直接导致了两个市场在投资风格、定价逻辑和流动性特征上的分野。
更深层次的差异还在于制度设计本身。在组织形式上，北交所采用公司制，与国际主流交易所接轨，而沪深交易所是传统的会员制。这一根本区别影响了其运行逻辑和激励机制。更为独特的是，北交所与新三板（全国中小企业股份转让系统）实行一体化管理，构建了基础层-创新层-北交所层层递进的市场结构，企业可以通过层层培育最终实现上市。北交所还建立了向沪深交易所的转板机制，优质企业可沿此路径继续发展。这种与新三板紧密联动的、作为孵化器和中转站的市场功能，是沪深交易所所不具备的，它们更类似于企业发展的主舞台。
